期刊简介

               本刊于1995年创刊,主要报道预防医学领域的科研成果、先进方法和经验总结等。已被15家国内外著名的检索性期刊和数据库收录,受到读者和同行专家的好评。                

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  • 杂志名称:应用预防医学杂志
  • 主管单位:广西壮族自治区卫生厅
  • 主办单位:广西壮族自治区疾病预防控制中心
  • 国际刊号:1673-758X
  • 国内刊号:45-1345/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:广西优秀科技期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), 万方收录(中)
应用预防医学杂志2016年第01期

南宁市朝阳溪污水中诺如病毒GⅡ.4型变异株基因分析

邓丽丽;刘巍;谭冬梅;马宇燕;韦一知;韦敬航;梁亮;钟革

关键词:污水, 诺如病毒, 基因型, GII.4型变异株, 序列分析
摘要:目的:了解南宁市朝阳溪污水中诺如病毒(Norovirus, NV) GⅡ.4变异株的基因特征。方法2011年1~12月采集72份南宁市朝阳溪污水,经实时荧光逆转录-聚合酶反应(Realtime RT-PCR)方法进行 NV 核糖核酸(RNA)检测,阳性标本进行基因克隆测序和遗传进化分析。结果72份污水中均能检测到 NV RNA,基因Ⅰ组(GenogroupⅠ,GⅠ) NV RNA阳性率为70.83%,基因Ⅱ组(GenogroupⅡ,GⅡ)阳性率则达100.00%,共为16个基因型,有18株为GⅡ.4型,其中2株为2006b变异株,其余16株均为2010变异株。检测到的2006b变异株和2010变异株在衣壳蛋白N/S区第94位氨基酸均发生变异,而在第6位、第15位仅2010变异株发生了变异,2006b变异株(除SW2011041-2株外)均无变异。这些变异株与同年南宁市腹泻病例中 NV GⅡ.4型变异株核苷酸型内同源性分别为96.70%~98.93%和97.42%~99.64%。结论南宁市朝阳溪污水中NV存在很高的遗传多样性,其来源可能是周边居民中的感染者;GⅡ.4型NV中2010变异株为优势株,其在人群中可能存在隐性感染;污水监测是人间NV感染监测的重要补充。